土壤种类不同，施肥引起土壤性质的变化有一定的差异。如显酸性的敏化土，施用有机肥料，其灰化过程减弱，酸度降低；黑土潜在肥力较高，有效肥力较低，施用有机肥料能增强土壤生物，生物化学活性，提高土壤有效肥力水平。但是，施肥导致土壤性质的变化亦有共同之处。尤其长期施用有机肥料，土壤腐殖质含量增加，品质得到改善，胡敏酸含量增高，胡敏酸与富里酸比值增大，土壤养分状况得到明显改善。同时，还会引起土壤空气状况的变化。有机物质分解产生大量CO2，改变了土壤空气组分的比纠，增强了土壤与大气间的气体交换功能，有利于地面植物的光合作用。

有机肥料堵肥土壤，引起土壤能量变化。土壤有机物质能量是光台作用转化柏结果，是以有机物质中化学能的形式存在的太阳能。土壤有机物质的积累是能量积累过程，有机物质的矿化则是消耗能量的过程。耕作土壤施用有机肥料的教量直接影响能量在土壤中的积累量。