大量的试验结果表明，蚯蚓的摄食植物残体，排泄粪便和打洞等生命活动。耕种了土地，增加了土壤的孔隙，在蚯蚓粪便及其栖息地域的周围富积了营养分，从而改善了土壤的理化性，提高了土壤肥力。

蚯蚓分解土壤有机质的作用，主要依靠存在于蚯蚓消化道中的纤维素酶和几丁质酶等的活性。这些酶是由蚯蚓本身分泌的，而不是某些节肢动物是由共生的微生物所分泌。蚯蚓肠道中虽然也有微生物存在，有时数量还商于周围的土壤。但蚯蚓肠道中似乎并没有一套固有的肠道微生物区系。有些徽生物在体内还受到肠道分泌物的阻碍，抑制，有些甚至被杀死。但是，蚯蚓粪中却有大量微生物存在。蚯蚓粪中微生物区系群体的大小，一般决定于其中所含消化了的植物物质的类型和数量。土壤中的蚯蚓，不仅能通过自身摄食、粉碎和搬运等来帮助土壤有机物质的分解，而且蚯蚓活动时所产生的废物，还能刺激微坐物的分解过程。