根据苦瓜的需肥规律和安全高效生产要点，苦瓜在施肥方面应采取底肥为主，追肥为辅的科学施肥方法。在施足有机肥的情况下，补充适量的化学肥料。施肥量可根据土壤供肥情况和目标产量进行确定，按总施肥量的70%做底肥、30%做追肥进行使用。

苦瓜的基肥，是指在苦瓜播种或定植前施用的肥料。它不但能提供苦瓜植株整个生长期所需要的养分，为苦瓜生长发育创造良好的营养条件，而且还具有改良土壤、培肥地力的作用。做基肥施用的肥料大多是迟效性的肥料，有机肥是最常用的基肥。化学肥料的全效缓释肥或磷肥和钾肥一般也做基肥施用。常用基肥施用方法如下：

普遍撒施 将肥料均匀的撒于地面，然后用犁耙耕作，把肥料翻入土壤里面，使肥料与土壤充分混合均匀。其特点是方法简单易行，根系吸肥面积大，但需要施肥量大。

沟施 在耕翻整地后，在田间放线开沟，然后把肥料均匀的撒入沟内，上面覆土，以备播种或栽苗。其特点是节省肥料，有利于提高肥效，但根系吸肥面积小。

穴施 田间翻耕整平后，按行距放线，按株距挖穴，把肥料施入穴里并覆土，供栽苗备用，该法既节约肥料，又能提高肥效，但较费工。

追肥应按照前期轻、中期重、后期补的原则进行，一般于开花坐果后进行第一次追肥，生物有机肥50千克/亩或尿素15-20千克、硫酸钾10-15千克/亩。以后每采收一次瓜，每亩再追施尿素15千克。每采收2次瓜追施生物有机肥50千克/亩，以防止植株早衰而影响果实生长。