秋播芹菜营养生长盛期养分吸收量高，此期芹菜对氮、磷、钾、镁、钙五要素的吸收量占总吸收量的84%以上。芹菜需氮量最高，钙、钾次之，磷、镁最少。芹菜对硼的需要量也很大，在缺硼的土壤或由于干旱低温抑制吸收时，叶柄易横裂，即“茎折病”，严重影响产量和品质。

常规施肥一般就是有机肥作基肥，氮钾肥分基肥和三次施肥，磷肥全部作基肥。施用基肥时，化肥和有机肥最好混合后沟施，肥力比较低的地块一般每亩施用有机肥2000-2500千克，磷酸二铵15-17千克，尿素4-5千克或者硫铵9-12千克，硫酸钾5-7千克；中等肥力的地块每亩施用有机肥1500-2000千克，磷酸二铵13-15千克，尿素4-5千克或者硫铵9-12千克，硫酸钾4-5千克；肥力比较高的地块每亩施用有机肥1000-1500千克，磷酸二铵11-13千克，尿素3-4千克或硫铵7-9千克，硫酸钾3-5千克。

专用肥施肥：在常规施用有机肥的基础上，亩基施专用肥35-40千克，心叶生长期施专用肥10千克，旺盛生长初期施专用肥10-15千克，旺盛生长中期施尿素10-15千克。

根外追肥：如发现心腐病，可用0.3%-0.5%硝酸钙或氯化钙进行叶面喷洒。叶面喷施硼肥可在一定程度上避免茎裂的发生，每次每亩喷施0.2%硼砂或硼酸溶液40-75千克。设施冬春季芹菜可使用二氧化碳吊袋肥。